Prebiotyki zastosowane w paszy, wodzie do picia czy też preparatach mlekozastępczych dostarczają składników pokarmowych dla mikroorganizmów naturalnie zasiedlających przewód pokarmowy u zwierząt monogastrycznych lub dla mikroflory żwacza w przypadku przeżuwaczy. Preparaty tego typu w sposób pośredni korzystnie oddziaływują na organizm zwierzęcia wpływając na wzrost efektywności produkcji. Korzyści z zastosowania prebiotyków to:
• stymulacja rozwoju pożądanej mikroflory i zapewnienie równowagi mikrobiologicznej w przewodzie pokarmowym
• efektywne ograniczanie namnażania i wzrostu bakterii patogennych
• pobudzanie mechanizmów układu odpornościowego,
• stymulacja procesów fermentacji w żwaczu u krów mlecznych w kierunku zwiększenia produkcji mleka.